Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sgo2bJ3QMK1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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