Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Vmn1r167G3UW71 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms