Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm20538F6Z9R1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Gm20538F6Z9R1 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms