Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm28305F6U473 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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