Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc17E9PVB5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms