Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb3D3Z6J4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms