Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rfx8D3YU81 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rfx8D3YU81 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rfx8D3YU81 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rfx8D3YU81 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rfx8D3YU81 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rfx8D3YU81 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rfx8D3YU81 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx8D3YU81 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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