Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rrn3B2RS91 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rrn3B2RS91 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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