Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Vmn1r232A2RTT5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vmn1r232A2RTT5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms