Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramel3A2AHA7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms