Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Knop1Q9Z2Q2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms