Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms