Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TapbpQ9R233 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TapbpQ9R233 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms