Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Gpc6Q9R087 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpc6Q9R087 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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