Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt1Q9JMD1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms