Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn12Q9ET43 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms