Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cldn19Q9ET38 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn19Q9ET38 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cldn19Q9ET38 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn19Q9ET38 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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