Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms