Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmg20aQ9DC33 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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