Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SelenooQ9DBC0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms