Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cab39lQ9DB16 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cab39lQ9DB16 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cab39lQ9DB16 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cab39lQ9DB16 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cab39lQ9DB16 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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