Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ift43Q9DA69 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ift43Q9DA69 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms