Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg7Q9D906 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg7Q9D906 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms