Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chmp4bQ9D8B3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms