Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lonrf3Q9D4H7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms