Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Mrpl28Q9D1B9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mrpl28Q9D1B9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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