Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf146Q9CZW6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf146Q9CZW6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf146Q9CZW6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf146Q9CZW6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf146Q9CZW6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf146Q9CZW6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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