Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Sgo1Q9CXH7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sgo1Q9CXH7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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