Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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