Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rpusd4Q9CWX4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rpusd4Q9CWX4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rpusd4Q9CWX4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpusd4Q9CWX4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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