Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snw1Q9CSN1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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