Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PompQ9CQT5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms