Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms