Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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