Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
StambpQ9CQ26 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms