Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nsmce3Q9CPR8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nsmce3Q9CPR8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nsmce3Q9CPR8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nsmce3Q9CPR8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nsmce3Q9CPR8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nsmce3Q9CPR8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nsmce3Q9CPR8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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