Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SncaipQ99ME3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms