Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gps1Q99LD4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gps1Q99LD4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms