Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tlcd1Q99JT6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms