Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Prss28Q924N9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prss28Q924N9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms