Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx9Q91VH2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms