Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fyco1Q8VDC1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms