Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CipcQ8R0W1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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