Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0W3

Rnf208, RING finger protein 208, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf208Q8K0W3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf208Q8K0W3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf208Q8K0W3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms