Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trip10Q8CJ53 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms