Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SltmQ8CH25 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms