Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hpf1Q8CFE2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hpf1Q8CFE2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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