Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc17Q8CE13 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms