Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Lrif1Q8CDD9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrif1Q8CDD9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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