Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4aQ8C9S8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Atg4aQ8C9S8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Atg4aQ8C9S8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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Atg4aQ8C9S8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Atg4aQ8C9S8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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